Les objectifs du Museum de la Citadelle (en lien avec la thématique de la biodiversité) sont :
Conservation et reproduction des espèces menacées : Apron du Rhône, Ecrevisse des torrents, Ibis chauve, ou encore la conservation ex-situ de 37 EEP (programmes d’élevage européens pour préserver la diversité génétique d’une population captive pour une espèce donnée en vue d’une possible réintroduction)
Mobilisation de l’établissement, en particulier, pour la conservation in-situ des espèces sensibles de la faune sauvage locale à la Citadelle (Faucon pèlerin, Grand Rhinolophe, Hibou Grand-duc, etc….), et des espèces exotiques en danger comme le Grand Hapalémur et le Propithèque couronné à Madagascar
Diffusion des connaissances et sensibilisation des visiteurs Jardin zoologique : 3 000 m² ; Aquarium : 260 m² intérieur et 550 m² extérieur ; Noctarium : 200 m² Insectarium : 330 m² ; Naturalium (ouverture fin mai 2017) : 170 m²
Recherche : en partenariat avec les universités, les laboratoires, CNRS, IRD, etc… sur des thématiques diverses : éthologie animale, reproduction, zoonoses, médecine vétérinaire, anatomie comparée, etc…
Education
Archives : collections de botanique ou d’entomologie du Muséum de Besançon
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